Od momentu debiutu Seat Alhambra zmieniał się niewiele. Jedynie w 2000 roku przeprowadzono lifting zmieniając głównie przednią część nadwozia.
Alhambra ma opinię samochodu względnie bezawaryjnego. W starszych samochodach zdarzają się usterki cewek zapłonowych, pompy wody oraz skrzyni biegów. Regularnego serwisowanie wymaga również zawieszenie, ale za to trzeba winić stan polskich dróg. Zdarzają się usterki sprężarki klimatyzacji oraz awarie wycieraczek.