Auto jest identyczne z hatchbackiem do środkowego słupka. Różnice zaczynają się więc dopiero w tylnej części nadwozia. Clubman jest o 24 cm dłuższy, ma o 8 cm większy rozstaw osi, co wpłynęło na ilość miejsca na tylnej kanapie. Ciekawie rozwiązano dostęp do bagażnika, zamiast klasycznej, podnoszonej do góry klapy, zdecydowano się na parę otwieranych do boku drzwi.

Mini Clubman dostępny jest w tych samych wersjach co hatchback, a więc jako One, Cooper, Cooper S, Cooper D i John Cooper Works. Podstawowa różnica między nimi to różne jednostki napędowe.